A Universidade aparece entre as 27 instituições públicas de ensino superior que alcançaram a faixa máxima (5) no Índice Geral de Cursos (IGC) do Ministério da Educação (MEC), sendo a segunda com a melhor avaliação. Esse indicador avalia a qualidade de ensino das instituições, com base na média ponderada dos conceitos preliminares de curso e nos conceitos da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes), responsável por avaliar os programas de pós-graduação das instituições.   

Os resultados apresentados pelo Ministério compõem o primeiro ciclo completo dos indicadores de qualidade, apurados de 2008 a 2011, que abrangem 18.346 cursos de 2.136 instituições. A tabela de conceitos do IGC 2011 mostra que, com 13 cursos avaliados, a UFABC obteve os seguintes índices nas avaliações:

Outras informações e documentos sobre os resultados do IGC estão disponíveis no portal do MEC. (LINK p/ http://portal.mec.gov.br/index.php?option=com_content&view=article&id=18290)